При обработке кислых почв (рН 5,0) возрастающими концентрациями токсичных газов наблюдается существенное уменьшение активности нитрификации, снижение рН до 4,5 и накопление сульфатов. Однако результаты лабораторных экспериментов не всегда находят подтверждение в условиях реального промышленного загрязнения почв, где комплексный состав атмосферных выбросов представлен не только токсичными, но и рядом биофильных соединений. Относительное превышение токсического или стимулирующего эффекта таких выбросов и будет определять их влияние на интенсивность микробиологических процессов в почве. Было показано, что в окрестностях металлургического комбината, выбрасывающего в атмосферу медь и цинк, происходит подавление активности аммонификации и наблюдается отрицательная корреляция между содержанием в почве металлов и аммонийного азота. Загрязнение почвы соединениями меди и никеля подавляет активность азотфиксации, аммонификации и нитрификации. При этом в течение первого года поступления промышленных выбросов заметного подавления микробиологических процессов не наблюдается, однако к концу четвертого года активность азотфиксации снизилась практически до нуля.