При фумигации растений азотсодержащими газами в них, как правило, увеличивается содержание органических и минеральных форм азота. У устойчивых видов растений накапливается больше белкового и аминного азота. Поглощенные токсиканты у них более активно вовлекаются в белковый обмен, что, возможно, и обеспечивает повышенную устойчивость. Неустойчивые виды накапливают больше минерального азота. Фумигация растений аммиаком ведет к накоплению преимущественно NH4+, а при воздействии окислов азота накапливаются нитраты.
Нарушения азотного обмена у растений, подверженных воздействию токсичных газов, характеризуются усилением распада белков и накоплением аммония, происходят изменения в содержании и соотношении свободных аминокислот. При скрытых признаках поражения на начальных этапах повреждения растений нарушение азотного обмена сопровождается усиленным поглощением азота корнями и притоком его к поврежденным органам, что приводит к повышению содержания в них общего и белкового азота. Подобные результаты получены при изучении химического состава листьев древесных пород в зоне влияния промышленных предприятий, а также при искусственной фумигации растений токсичными газами.