Амилолитическое микробное сообщество дерново-подзолистой почвы устойчиво к действию кадмия до концентрации 7 мг/кг. Однако потенциальная токсичность кадмия снижается в почвах с повышенной кислотностью, что предполагает уменьшение его опасности для лесных почв. Для дрожжей токсичность кадмия оказывается выше в аэробных условиях по сравнению с анаэробными.
Несмотря на необходимость цинка и меди для нормального метаболизма грибов, их сверхвысокие концентрации в почвах вблизи металлургических заводов оказались неблагоприятными для микробиологической минерализации. Пороги токсичности цинка составляют 100—200 мг/кг для Bacillus sp., неспорообразующих бактерий и актиномицетов, 100—1000 мг/кг — для грибов.
Отдельные группы микроорганизмов способны адаптироваться в определенных условиях среды обитания и противостоять токсичному воздействию загрязнителей. При загрязнении почв фенольными соединениями происходит активное развитие бактерий, использующих фенол в качестве субстрата жизнедеятельности. Численность фенолразрушающих бактерий в таких случаях бывает выше, чем в незагрязненных почвах. Актиномицеты и бактерии, выделенные из загрязненных цинком почв, были более устойчивы к токсическому действию цинка; они нормально развивались при концентрациях цинка на порядок выше концентраций, вызывающих угнетение роста микроорганизмов, выделенных из незагрязненных почв.