Высокий уровень загрязнения упрощает видовую структуру комплексов за счет уменьшения числа редко встречаемых видов, формирует новые, нетипичные для зональных почв комплексы грибов, в которых обычно доминируют виды с выраженными фитотоксичными свойствами. Для чувствительных видов установлены не только уменьшение встречаемости, но и изменение морфофункциональных показателей (задержка прорастания спор, уменьшение скорости роста мицелия, скорости спорообразования, изменение толщины мицелия). Уменьшение численности и биомассы грибов отмечено в почвах, загрязненных выбросами предприятий цветной металлургии. Выявлена взаимосвязь градиента концентрации тяжелых металлов, загрязняющих почву, с реакцией микробной системы почвы, которая проявляется в четырех качественно отличных состояниях, соответствующих зонам гомеостаза, стресса, резистентности и репрессии.