Системный подход выполняет функцию интеграции результатов исследований многих специалистов, позволяет перевести их на единый математический язык и эффективно использовать математические методы для построения целостных моделей БГХЦ, на которых можно воспроизводить результаты внешних воздействий. Несмотря на то, что исследование сложной динамической системы, какой является БГХЦ элементов в почве лесной экосистемы, на базе системного подхода представляет собой единый процесс с параллельными и последовательными разработками, циклами обратной связи между моделированием и экспериментом, целесообразно расчленить этот единый процесс на ряд последовательных этапов: 1. формулировка цели моделирования; 2. общая характеристика изучаемой экосистемы, исходя из поставленной цели и спецификация переменных модели; 3. идентификация структуры модели; 4. Синтез целостной математической модели; 5. проверка модели; 6. анализ и исследование модели. Цель моделирования — количественное описание взаимосвязанного протекания основных процессов превращения серы в дерново-подзолистых почвах лесной экосистемы для прогнозирования нарушения круговорота серы при поступлении дополнительных ее количеств из атмосферы и с растительным опадом.