Таким образом, изменение интенсивности трансформации органического вещества в почвах при их загрязнении зависит от состава токсикантов. Сильное загрязнение почв окислами серы, азота, серной кислотой, аммиаком, органическими компонентами тормозит скорость распада целлюлозы и интенсивность микробиологических процессов; ослабление воздействия загрязняющих компонентов приводит к резкому росту интенсивности деструкционных процессов. Загрязненные тяжелыми металлами и токсичными окислами почвы характеризуются пониженной интенсивностью трансформации органического вещества и снижением биологической активности почв, которое проявляется в падении интенсивности выделения углекислого газа и накопления аминокислот на ткани, уменьшении численности учтенных микроорганизмов, понижении полифенолоксидазной, дегидрогеназной, липазной активностей, проявлении токсичности почв.
При загрязнении почв органическими соединениями в верхних горизонтах возрастает скорость распада органического вещества и накопление аминокислот на ткани, увеличиваются количество микроорганизмов, учитываемых на фенольной среде, и полифенолоксидазная активность почв, что связано с активным развитием групп микроорганизмов, использующих в качестве субстрата органические загрязнители. Однако активность дегидрогеназы, липазы снижается, загрязненные почвы обнаруживают токсичность.